卷目导读
全书 100 卷 · 六段位分组
百卷依义理推进划为六段位，层层递进，脉络分明。
注：卷 86 依义理归属列入段位 04 末段，卷序仍承卷 85 之后，故段位之间略有跳号。
段位 01
宗轴奠基
5 卷立宗镜、明心体，以一心为全书宗轴。
卷 1 立宗标本
卷 2 护宗证知
卷 3 立宗辨心
卷 4 第四真心
卷 5 会道起信
段位 02
进入开路
7 卷破斥偏执，扫清入门障碍，指示观心正路。
卷 6 会道开门
卷 7 无性宗归
卷 8 无性宗眼
卷 9 一心绝妙
卷 10 心镜立宗
卷 11 教门归一
卷 12 理事无碍
段位 03
多说展开
32 卷广引圣言，博采教诠，展开一心义理之多面向。
卷 13 事事无碍
卷 14 即心即佛
卷 15 佛德圆具
卷 16 法身一多
卷 17 成佛时劫
卷 18 法身现不现
卷 19 众生即佛
卷 20 佛性同体
卷 21 净秽随心
卷 22 无相真发
卷 23 菩提现前
卷 24 一心立名
卷 25 诸经归心
卷 26 圆信归心
卷 27 万行道场归心
卷 28 十玄归心
卷 29 守心归教
卷 30 万门摄一
卷 31 一心解脱
卷 32 绝待眷属
卷 33 一心不迁
卷 34 四德圆修
卷 35 判教归心
卷 36 观修无住
卷 37 教观无念
卷 38 本觉十玄
卷 39 四念一心
卷 40 知宗办事
卷 41 宗镜相应
卷 42 一心因果
卷 43 教行归宗
卷 44 教观归宗
段位 04
差异安位
41 卷以唯识识相安差别教相之位，辨别诸宗差异，各安其位，会同于宗镜一心。
卷 45 无心省要
卷 46 息见六相
卷 47 藏识归宗
卷 48 种熏归心
卷 49 识缘中道
卷 50 本识立体
卷 51 安识护宗
卷 52 末那枢机
卷 53 六识识变
卷 54 根尘归空
卷 55 法处识位
卷 56 诸识归智
卷 57 心王心所
卷 58 有为无为
卷 59 百法三性
卷 60 三性四分
卷 61 离言机应
卷 62 破心外境
卷 63 唯识破内境
卷 64 梦觉收一心
卷 65 正见破我
卷 66 无我圆觉
卷 67 法我谛融
卷 68 三境识变
卷 69 三科归藏
卷 70 缘心亲疏
卷 71 缘果识报
卷 72 依处缘起
卷 73 识业唯心
卷 74 唯心因果
卷 75 识迁受报
卷 76 始终归心
卷 77 缘起归知
卷 78 一觉如梦
卷 79 闻境如幻
卷 80 如化见性
卷 81 万行一心
卷 82 止观圆断
卷 83 二谛一心
卷 84 破妄显真
卷 86 十如唯心
段位 05
边界裁定
9 卷起首归元、入门安位、边界裁定三子段，归摄纷异，裁定边界，安立入门正位。
卷 85 心量无外
卷 87 四门五位
卷 88 智位果圆
卷 89 体用归心
卷 90 三德指归
卷 91 应化智照
卷 92 知见归宗
卷 93 信毁归真
卷 94 一乘归心
段位 06
返照落实
6 卷返观自心，以宗镜之光照落日常修证。
卷 95 一心法界
卷 96 不动一心
卷 97 传灯归心
卷 98 返本心地
卷 99 文教归心
卷 100 全书归元